1992-2007

Lorsque le Prof. Alexander Zehnder, biochimiste, prit la direction de l’Eawag en 1992, une période de travail intensif l’attendait. La loi des EPF avait changé, et l’Eawag devint en 1993 une institution indépendante, comme les deux EPF de Zurich et de Lausanne ainsi que les trois autres instituts de recherche Empa, WSL et PSI. Grâce à son engagement scientifique, ses activités d’ambassadeur et ses contacts à travers le monde avec des instituts prestigieux, Zehnder motiva de nombreux collaborateurs à se distinguer par leurs travaux de recherche indépendants et innovateurs. Sous sa direction, l’Eawag commença à s’occuper de la disponibilité des eaux, en particulier pour la production alimentaire. Il posa des jalons importants dans les domaines de l’élimination des polluants, des biofilms et de la protection contre la corrosion. Dans le domaine de l’écotoxicologie, il a revendiqué un changement en faveur de la compréhension des processus plutôt que de n’en décrire que les effets. Zehnder encouragea encore plus clairement que Stumm le travail collaboratif interdisciplinaire ainsi que la prise en compte de la mise à exécution et de la pratique, par exemple au moyen des initiatives comme l'initiative Fischnetz (la diminution de la population des poissons en Suisse) ou Greenhydro (hydroélectricité écologiquement responsable). Lorsque le Prof. Alexander Zehnder fut élu président du CEPF à l’été 2004, son adjoint, l’ingénieur culturel Ueli Bundi, prit la direction intérimaire de l’Eawag.