Abteilung Umweltmikrobiologie

Ökologie Mikrobieller Systeme

Forschungsgebiete

Unsere Forschungsgruppe arbeitet an grundsätzlichen Fragen zur Evolution und Ökologie von Mikroorganismen: an der biologischen Bedeutung von phänotypischer Variation in klonalen Populationen, an Interaktionen innerhalb und zwischen Arten, und an der Frage wie Bakterien sich an wechselnde Umweltbedingungen anpassen.

Wir arbeiten an grundsätzlichen Prinzipien mit genetischen Modellsystemen im Labor und testen dann diese Prinzipien in der natürlichen Umwelt. Die Gruppe arbeitet oft auf der Skala von einzelnen Zellen, und gewinnt so Einsichten die in konventionellen Experimenten auf Populationsebene verborgen bleiben. Eines der aktuellen Hauptinteressen ist die Frage wie stochastische Aspekte der Genexpression phänotypische Vielfalt in klonalen Populationen hervorrufen, und wie diese Vielfalt zu Interaktionen innerhalb und zwischen Populationen führt.

Mehr Informationen finden Sie hier:  www.mme.ethz.ch

Gruppenleiter

Publikationen

Balaban, N. Q.; Helaine, S.; Lewis, K.; Ackermann, M.; Aldridge, B.; Andersson, D. I.; Brynildsen, M. P.; Bumann, D.; Camilli, A.; Collins, J. J.; Dehio, C.; Fortune, S.; Ghigo, J.- M.; Hardt, W.- D.; Harms, A.; Heinemann, M.; Hung, D. T.; Jenal, U.; Levin, B. R.; Michiels, J.; Storz, G.; Tan, M.-W.; Tenson, T.; Van Melderen, L.; Zinkernagel, A. (2019) Definitions and guidelines for research on antibiotic persistence, Nature Reviews Microbiology, 17, 441-448, doi:10.1038/s41579-019-0196-3, Institutional Repository
Povolo, V. R.; Ackermann, M. (2019) Disseminating antibiotic resistance during treatment. A multidrug efflux pump can help bacteria acquire antibiotic resistance through plasmid transfer, Science, 364(6442), 737-738, doi:10.1126/science.aax6620, Institutional Repository
Rodríguez-Verdugo, A.; Vulin, C.; Ackermann, M. (2019) The rate of environmental fluctuations shapes ecological dynamics in a two-species microbial system, Ecology Letters, 22(5), 838-846, doi:10.1111/ele.13241, Institutional Repository
Vulin, C.; Leimer, N.; Huemer, M.; Ackermann, M.; Zinkernagel, A. S. (2018) Prolonged bacterial lag time results in small colony variants that represent a sub-population of persisters, Nature Communications, 9(1), 4074 (8 pp.), doi:10.1038/s41467-018-06527-0, Institutional Repository
Louca, S.; Polz, M. F.; Mazel, F.; Albright, M. B. N.; Huber, J. A.; O'Connor, M. I.; Ackermann, M.; Hahn, A. S.; Srivastava, D. S.; Crowe, S. A.; Doebeli, M.; Wegener Parfrey, L. (2018) Function and functional redundancy in microbial systems, Nature Ecology & Evolution, 2, 936-943, doi:10.1038/s41559-018-0519-1, Institutional Repository
D'Souza, G.; Shitut, S.; Preussger, D.; Yousif, G.; Waschina, S.; Kost, C. (2018) Ecology and evolution of metabolic cross-feeding interactions in bacteria, Natural Product Reports, 35(5), 455-488, doi:10.1039/C8NP00009C, Institutional Repository

Projekte

Es ist ein grosses Ziel, besser zu verstehen, wie mikrobielle Gemeinschaften funktionien, wie Mikroben miteinander interagieren und wie diese Interaktionen die Funktionen der Gemeinschaft bestimmen.
Unterschiede zwischen einzelnen Bakterienzellen können biologisch wichtig sein.
Individuelle Variation und zelluläres Gedächtnis helfen Bakterien um mit Änderungen in den Umweltbedingungen umzugehen.
Auch ohne genetische Resistenz können Bakterien tolerant sein gegen Antibiotika.