Détail
Les facteurs invisibles à l'origine des proliférations de cyanobactéries
20 juillet 2026 |
Lorsque les cyanobactéries se multiplient de manière explosive, la prudence est de mise. En effet, certaines de ces bactéries, également appelées « algues bleues », produisent des toxines. De telles proliférations d'algues toxiques surviennent régulièrement dans les lacs suisses. Les autorités déconseillent alors vivement la baignade ou interdisent l'accès à certaines zones du lac, car l'ingestion d'eau peut entraîner des diarrhées, des vomissements, voire des lésions hépatiques. Pour les chiens, une baignade dans un tapis d'algues peut même être mortelle.
Il est difficile de déterminer à temps quand et où ces tapis d’algues bleues vont se former. Lorsque les conditions sont réunies, les proliférations d’algues bleues se développent en l’espace de quelques jours. Elles nécessitent notamment des températures d’eau élevées et une forte concentration en nutriments. « Aujourd’hui, les prévisions s’appuient presque exclusivement sur ces facteurs environnementaux abiotiques, mais cela ne suffit pas pour établir des prévisions précises », explique Francesco Pomati, responsable du groupe de recherche « Écologie du plancton » à l’Institut de recherche sur l’eau Eawag.
En effet, la croissance des cyanobactéries toxiques dépend aussi de manière déterminante des autres organismes présents dans leur environnement immédiat et de la manière dont elles interagissent avec eux. C’est ce que montre une étude à long terme menée par l’équipe d’écologie du plancton et récemment publiée dans la revue spécialisée «Nature Ecology & Evolution». La première autrice de l’étude est Pinelopi Ntetsika, doctorante à l’Eawag. Pour cela, elle a analysé une quantité considérable de données recueillies par le groupe de recherche sur une période de cinq ans dans le lac de Greifen, dans le canton de Zurich, dans le cadre du projet à long terme «Aquascope».
Microscope sous-marin dans le lac
L'objectif d'«Aquascope» est d'étudier les communautés de plancton dans leur milieu naturel, sans perturber les interactions et la dynamique entre les espèces. Un microscope sous-marin automatisé photographie toutes les heures, 24 heures sur 24, tous les organismes présents dans l’eau, dont la taille varie de cinq micromètres à un centimètre, et les classe à l’aide de l’intelligence artificielle. « La caméra nous permet de plonger dans un monde totalement nouveau et, pour la première fois, de photographier le plancton directement dans un lac », explique Francesco Pomati. « Nous avons pour ainsi dire un œil dans l’eau et observons ces minuscules et magnifiques créatures – comme avec une caméra de surveillance de la faune sauvage dans la savane. »
Au total, les chercheurs ont recensé 83 groupes différents d’organismes planctoniques au cours de la période d’étude. En y ajoutant tous les paramètres physiques et chimiques importants, cela a représenté plus de 1 700 points de mesure par jour. Cela a permis de dresser un tableau d’une précision sans précédent de l’évolution quotidienne des populations de cyanobactéries, qu’elles augmentent ou diminuent.
L’étude s’est concentrée sur deux groupes de cyanobactéries toxiques d’importance mondiale : Microcystis et Dolichospermum. Tous deux peuvent produire des toxines dangereuses, mais se distinguent par leur stratégie écologique. Microcystis forme souvent des efflorescences de surface denses dans des eaux chaudes et riches en nutriments. Dolichospermum préfère quant à lui des conditions de nutrition plutôt modérées.
Le microscope sous-marin installé dans le Greifensee photographie même les espèces de plancton les plus minuscules. L'Aquascope les immortalise toutes les heures. (Photos : Eawag)
Prédateurs et protecteurs
Afin de comprendre pourquoi les populations de cyanobactéries évoluent, les chercheurs ont calculé l'augmentation ou la diminution quotidienne de la biomasse – ce que l'on appelle les taux de croissance nets. À l’aide d’une méthode d’analyse récemment mise au point, ils ont quantifié dans quelle mesure un facteur donné modifiait les conditions de température et de nutriments nécessaires à la croissance des cyanobactéries. Les résultats révèlent un système extrêmement complexe. Les facteurs environnementaux classiques, tels que la température ou les phosphates, influencent certes nettement les cyanobactéries. « Mais à l’échelle quotidienne, les facteurs biologiques se sont avérés encore plus importants », explique Pinelopi Ntetsika.
Certains groupes de zooplancton et d’autres algues ont eu des effets particulièrement importants. Les rotifères, par exemple, ont un effet inhibiteur sur les cyanobactéries. Il s’agit d’animaux aquatiques microscopiques qui tirent leur nom d’une couronne de cils située sur leur tête, qui se déplace comme des roues en rotation. Des densités élevées de rotifères ont augmenté d’environ 13 degrés Celsius la température de l’eau nécessaire à l’accumulation de la biomasse de Dolichospermum. «De toute évidence, les rotifères se nourrissent de cyanobactéries et jouent un rôle de régulateurs», explique Pinelopi Ntetsika. «C'était surprenant. Jusqu'à présent, on pensait que les puces d'eau, appelées daphnies, étaient les principaux prédateurs des cyanobactéries.»
D’autres organismes ont eu l’effet inverse. Les chrysophytes, en particulier, un groupe d’organismes unicellulaires généralement de couleur brun doré, semblent favoriser la croissance des cyanobactéries. En leur présence, les populations de Dolichospermum se développaient déjà à des températures de l’eau inférieures de près de neuf degrés et à des concentrations de phosphore extrêmement faibles.
De nouvelles possibilités de prévision
La manière dont ces interactions synergiques se produisent n’a jusqu’à présent guère été étudiée. Il se pourrait, par exemple, qu’une espèce excrète certains métabolites dont une autre espèce a besoin comme source de nutriments, explique Pinelopi Ntetsika. « Ou bien : un organisme planctonivore préfère une algue verte, car elle est plus facile à digérer qu’une algue bleue. Lorsque les deux coexistent, l’algue bleue en profite, car la pression de prédation dont elle fait l’objet diminue. »
Selon l’étude, les conditions propices à une prolifération d’algues résultent donc de processus dynamiques liés à l’interaction de nombreuses espèces au sein de l’écosystème. Une température qui ne déclenche pas de prolifération une année donnée peut soudainement devenir très problématique si les conditions biologiques changent. À l’inverse, un été chaud dans un lac riche en nutriments ne conduit pas nécessairement à une prolifération massive d’algues bleues.
Ces résultats ont également une importance pratique pour la gestion des cours d’eau. Au lieu de se limiter à la température, au phosphore ou à l’azote, les chercheurs proposent de surveiller davantage certains groupes de plancton à l’avenir. La fréquence des rotifères, des puces d’eau ou des chrysophytes pourrait fournir des indices permettant de déterminer si une prolifération de cyanobactéries est en train de se développer dans un lac.
Toutefois, les interactions entre les espèces sont extrêmement complexes et dépendent du site. « Nos résultats s’appliquent au lac de Greifen – dans d’autres lacs, d’autres espèces et interactions pourraient jouer un rôle important dans la croissance des cyanobactéries », explique Pinelopi Ntetsika. Pour étudier ces différences, il faut mener davantage de recherches – et disposer de davantage de microscopes sous-marins automatisés, tels que ceux utilisés par l’équipe sur le lac de Greifen. Francesco Pomati et Pinelopi Ntetsika en sont convaincus : c’est ainsi que les mystères des proliférations d’algues bleues pourront être élucidés petit à petit.
Photo de couverture : ce qui ressemble à des traînées de saleté est en réalité des cyanobactéries toxiques. (Photo : Francesco Pomati, Eawag)
Publication originale
Ntetsika P.; Eyring S.; Merz E.; Reyes M.; Käch B.; Munch S.; Dennis S.; Baity-Jesi M.; Pomati F. (2026) Biotic interactions shape the realised niche of toxic cyanobacteria, Nature Ecology & Evolution, https://www.nature.com/articles/s41559-026-03131-0