Abteilung Umweltmikrobiologie

Entwicklung einer kostengünstigen Methode zur globalen Antibiotikaresistenzdetektion

Antimikrobielle Resistenzen haben sich im Verlauf des letzten Jahrhunderts weltweit zur einer der grössten drohenden Gefahren für die menschliche Gesundheit entwickelt. Trotz dieser ernsten Lage ist wenig über die globale Verbreitung der Antibiotikaresistenzen bekannt, vor allem nicht in Ländern mit geringem Bruttosozialprodukt und begrenzter medizinischer Infrastruktur. Hierfür entwickeln wir ein extrem kostengünstiges Verfahren, um auf nationaler Ebene repräsentative Schätzungen für die Verbreitung von Antibiotikaresistenz-Genen zu erhalten. Kostengünstig wird das Verfahren dadurch, dass wir neuartige molekularbiologische Werkzeuge einsetzen, welche die enorme Datentiefe der Sequenzierung der nächsten Generation („next generation sequencing“) bestmöglich ausnutzen. Diese neue Methode wird mit einfachen und standardisierten Probenentnahmen sowie einer automatisierten Datenanalyse verknüpft und zielt darauf ab, die Existenz von bis zu 30 Antibiotikaresistenzgenen in tausenden Proben gleichzeitig und zuverlässig abzuschätzen.