Abteilung Umweltchemie

Analytische software

envihomolog - N E U -

Website zur Detektion und Visualisierung von Signalmustern homologer Substanzen in LC-MS Daten, basierend auf dem R-Paket nontarget. Zur Detektion müssen gepickte und bestenfalls isotopenbereinigte LC-MS peaks auf die Website hochgeladen werden. Ergebnisse können wiederum im .csv-Format runtergeladen werden. Am besten angezeigt mit den Webbrowsern Firefox, Google Chrome oder Safari.

enviPat Website

Basiert auf dem R-Paket desselben Namens, Web-Schnittstelle zur Berechnung von Isotopenmustern (Feinstruktur), Profilen, Zentroiden und Intensoiden. Auflösung isotopischer Feinstrukturen auch bei grossen Molekülen. Möglichkeit der Nutzung von Auflösungen eingebauter Instrumente, vordefinierter oder benutzerdefinierter Addukte und Batch-Verarbeitung. Am besten angezeigt in Firefox, Google Chrome und Safari.

R package 'nontarget'

R-Tool zur Gruppierung von Isotopen und Addukten mit Komponenten sowie Erkennung homologer Reihen aus hochauflösenden Massenspektrometer-Datensätzen.

R-Paket „RMassBank“

R-Tool zur Batch-Verarbeitung, Rekalibrierung und zum Clean-up von HRMS-Spektra und zur MassBank-Datengenerierung.

Beispieldaten für RMassBank (Rohdateien, ~50 MB)

R-Paket „enviPick“

Partitionierung, EIC-Clustering und Peak-Detektion für Baseline-korrigierte und Schwerpunkt-LC-HRMS-Daten im mzXML-Format. Anzeige interaktiver Ergebnisse und Rohdaten, Batch-Verarbeitung & browserbasierte Benutzerschnittstelle.