Carsten Schubert a étudié la géologie à la Justus-Liebig Universität de Giessen (Allemagne). Il est arrivé à l’Eawag en 2001 pour prendre la tête du groupe de biogéochimie. Il dirige en outre le département Eaux de surface depuis 2012. Depuis 2004, Carsten Schubert est chargé d’enseignement à l’EPF Zurich et professeur titulaire depuis 2019.

Il prendra ses nouvelles fonctions le 1er avril 2021 et succèdera à Johnny Wüest, membre de la direction depuis 2015, qui prend sa retraite. Comme son prédécesseur, Carsten Schubert représentera le site de l’Eawag de Kastanienbaum au sein de la direction.