Département Ecologie et évolution des poissons

Écologie et évolution des poissons (FishEc)

Nous étudions l'écologie, l'évolution et la biodiversité des organismes aquatiques, en particulier des poissons, des leurs proies et de leurs enemies. L'accent est mis ici sur la dynamique évolutionnaire et écologique de la diversité.

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News

Exceptionnelle diversité des corégones

Couple de corégones (C. lavaretus) frayant près de la rive dans le lac d'Aiguebelette (Photo : Alamy).
9 mai 2025 –

La diversité des espèces de corégones dans les lacs suisses est unique et joue un rôle central dans les écosystèmes lacustres. Un rapport complet de l'Eawag rassemble aujourd'hui les résultats de 150 années de recherche sur ces...

La diversité des espèces de corégones dans les lacs suisses est unique et joue un rôle central dans les écosystèmes lacustres. Un rapport complet de l'Eawag rassemble aujourd'hui les résultats de 150 années de recherche sur ces poissons. Ils montrent que pour préserver cette biodiversité, il faut tenir compte des mécanismes et des conditions environnementales qui ont contribué à son développement. Enfin, la protection de la diversité des corégones contribue à préserver le potentiel de rendement naturel des lacs en tant que source de nourriture pour l'homme.
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Découverte de deux nouvelles espèces de poissons dans les eaux suisses

L’équipe de recherche lors du prélèvement d’échantillons de poissons dans la Langete avec la méthode de la pêche électrique (Photo: Dario Josi).
11 février 2025 –

Par le biais d’un sondage, la population pourra décider comment nommer ces deux espèces découvertes par Bárbara Calegari et ses collègues. Dans cet interview, la biologiste explique où elles vivent et comment rendre visible la...

Par le biais d’un sondage, la population pourra décider comment nommer ces deux espèces découvertes par Bárbara Calegari et ses collègues. Dans cet interview, la biologiste explique où elles vivent et comment rendre visible la diversité de nos eaux.
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Evolution Letters Publikation von Dr. Alexus Roberts-Hugghis

Figure 1. in Dr. Alexus Roberts-Hugghis Publikation "A classic key innovation constrains oral jaw functional diversification in fishes"
27 janvier 2025 –

Un autre travail du Dr Alexus Roberts-Hugghis, qui montre que si la mâchoire pharyngienne modifiée représente sans aucun doute une innovation fonctionnelle, elle limite en même temps la diversification du système alimentaire.

Un autre travail du Dr Alexus Roberts-Hugghis, qui montre que si la mâchoire pharyngienne modifiée représente sans aucun doute une innovation fonctionnelle, elle limite en même temps la diversification du système alimentaire.
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Plus la biodiversité est grande, plus les nutriments sont abondants

Caloptéryx éclatant (lat. Calopteryx splendens ) avec sa proie (Photo: Maja Ilić).
17 octobre 2024 –

Les insectes et les araignées sont des super aliments: riches en acides gras essentiels, ils constituent une source d’alimentation importante pour les oiseaux, les poissons, les reptiles, les amphibiens et les petits mammifères.

Les insectes et les araignées sont des super aliments: riches en acides gras essentiels, ils constituent une source d’alimentation importante pour les oiseaux, les poissons, les reptiles, les amphibiens et les petits mammifères.
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Seminare

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Dernières publications

Ahi, E. P., Verta, J. P., Kurko, J., Ruokolainen, A., Singh, P., Debes, P. V., … Primmer, C. R. (2025). Brain-associated alterations of Hippo pathway transcription in early maturing Atlantic salmon. BMC Ecology and Evolution, 25, 53 (16 pp.). doi:10.1186/s12862-025-02398-4, Institutional Repository

Background: Pubertal timing is a key life history trait, shaped by ecological pressures to balance reproductive success and survival. Emerging evidence suggests a link between adiposity and early maturation, potentially through hormonal signaling pathways governing puberty timing. The timing of sexual maturation in Atlantic salmon has a strong genetic basis in addition to being linked with environmental shifts and lipid reserves. A gene encoding a co-factor of the Hippo pathway, vgll3, is a major determinant of maturation timing in salmon. The Hippo pathway is known for its evolutionary conserved molecular signal role in both sexual maturation and adipogenesis.
Results: In this study, we tested the expression of Hippo pathway genes in the brain of immature and mature male Atlantic salmon carrying either the early or the late maturation genotype of vgll3. We found increased brain expression of a major Hippo pathway kinase (lats1b) in individuals with early maturation genotypes of vgll3 before maturation development of testes was evident. Moreover, we found components and regulating partners of the Hippo pathway showing differential expression in brain of individuals with early and late vgll3 genotypes prior to maturation. This may suggest a role for the Hippo pathway in central nervous system processes that regulate the preparation for maturation.
Conclusions: This study characterizes transcriptional changes in components of the Hippo pathway in the brain in relation to vgll3-mediated early maturation in Atlantic salmon, highlighting the potential involvement of this pathway in the central regulation of maturation prior to gonadal development.
Almeida, M. V., Li, Z., Rebelo-Guiomar, P., Dallaire, A., Fiedler, L., Price, J. L., … Miska, E. A. (2025). Transposable elements drive regulatory and functional innovation of F-box genes. Molecular Biology and Evolution, 42(5), msaf097 (22 pp.). doi:10.1093/molbev/msaf097, Institutional Repository

Protein domains of transposable elements (TEs) and viruses increase the protein diversity of host genomes by recombining with other protein domains. By screening 10 million eukaryotic proteins, we identified several domains that define multicopy gene families and frequently co-occur with TE/viral domains. Among these, a Tc1/Mariner transposase helix-turn-helix (HTH) domain was captured by F-box genes in the Caenorhabditis genus, creating a new class of F-box genes. For specific members of this class, like fbxa-215, we found that the HTH domain is required for diverse processes including germ granule localization, fertility, and thermotolerance. Furthermore, we provide evidence that Heat Shock Factor 1 (HSF-1) mediates the transcriptional integration of fbxa-215 into the heat shock response by binding to Helitron TEs directly upstream of the fbxa-215 locus. The interactome of HTH-bearing F-box factors suggests roles in post-translational regulation and proteostasis, consistent with established functions of F-box proteins. Based on AlphaFold2 multimer proteome-wide screens, we propose that the HTH domain may diversify the repertoire of protein substrates that F-box factors regulate post-translationally. We also describe an independent capture of a TE domain by F-box genes in zebrafish. In conclusion, we identify two independent TE domain captures by F-box genes in eukaryotes and provide insights into how these novel proteins are integrated within host gene regulatory networks.

Projets de recherche

Wie wird Klimawandel die Phänologie, Biomasse, und Ernährungsqualität ökosystemübergreifender Flüsse verändern ?

Ernährungsphänologie im Zusammenhang mit Klimawandel
Korallenanpassung an zukünftige Klimazonen

Simulation der Reaktion von Korallenarten im roten Meer
Tropical Reef. Credit Conor Waldock
Simulation der Einflüsse von Ausbreitung, Wärmetoleranz und Anpassungsfähigkeit auf die Reaktion tropischer Rifffische auf den Klimawandel.

Simulation der Artenvielfalt tropischer Fische
In dieser grossangelegten Studie untersuchen wir die Auswirkungen des Klimawandels auf die Fischbewegungsmuster im Schweizer Rhein-Aare Flussnetz

Klimawandel und Fischbewegungsmuster

Autres projets de recherche