Département Microbiologie de l’environnement

In diesem Projekt untersuchen wir, wie mikrobielle Gemeinschaften und zentrale mikrobielle Funktionen auf Umweltveränderungen reagieren. Es fehlt bislang ein klares, systematisches Verständnis davon, wie spezifische Merkmale und Netzwerkstrukturen die Resilienz von mikrobiellen Gemeinschaften über verschiedene Bedingungen hinweg beeinflussen. Um diese Wissenslücke zu schließen, entwickeln wir gezielt synthetische bakterielle Gemeinschaften, die sich hinsichtlich ihrer Artenzusammensetzung, ihrer metabolischen Fähigkeiten und ihrer Interaktionsmuster unterscheiden, und greifen dabei auf Stammsammlungen aus marinen Habitaten zurück.

Mittels hochdurchsatzfähiger Tröpfchen-Mikrofluidik können wir gleichzeitig tausende Gemeinschaftskulturen vermessen und dabei Substratumsatz und Wachstum entlang von Gradienten in Temperatur, pH-Wert und Nährstoffkomplexität verfolgen. Dieser experimentelle Ansatz ermöglicht es uns zu prüfen, ob Resilienz aus gemeinsamen ökologischen Merkmalen hervorgeht und wie die verfügbaren Ressourcen und bakteriellen Interaktionen die Dynamik mikrobieller Gemeinschaften steuern.